ด้วยความมุ่งมันที่จะเพิ่มต้นไม้ยืนต้นให้กับแผ่นดินด้วยความร่วมมือร่วมใจของคนไทยทั่วประเทศ ตลอดระยะเวลา ๒๐ ปี มูลนิธิสถาบันราชพฤกษ์จึงได้ร่วมกับองค์กรต่าง ๆ ไม่ว่าจะเป็นภาครัฐ เอกชน องค์กรศาสนา ประชาชนทุกหมู่เหล่า ดำเนินโครงการในหลากหลายรูปแบบ ดังนี้

                วัดเป็นศาสนสถานที่พักพิงทั้งกายและใจให้กับพุทธศาสนิกชนทุกชนชั้น ดังนั้น เพื่อเป็นการส่งเสริมให้มีการปลูกต้นไม้สร้างความร่มรื่นให้กับวัดทั่วประเทศ มูลนิธิสถาบันราชพฤกษ์ ร่วมกับมหาเถรสมาคม กองทัพบก กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ กระทรวงมหาดไทย กระทรวงศึกษาธิการ และกรุงเทพมหานครจัดโครงการ“วัดและประชาร่วมใจ ปลูกต้นไม้ถวายราชสักการะในพระสังฆราชูปถัมภ์” ขึ้น และเพื่อให้วัดทุกวัดในทุกจังหวัดได้มีส่วนร่วมในโครงการมูลนิธิฯ จึงแบ่งลักษณะของการรณรงค์การปลูก และบำรุงต้นไม้เป็น ๒ รูปแบบคือ

                ๑. ทอดผ้าป่าต้นไม้ สำหรับวัดที่ไม่อาจหรือไม่เหมาะสมที่จะปลูกต้นไม้ยืนต้นเพิ่มเติมในบริเวณวัดได้
                     เพื่อนำเงินไปซื้อต้นไม้กระถางที่ทางวัดเห็นเหมาะสมและสมควรต่อไป 

                ๒. ปลูกต้นไม้ยืนต้นในวัดที่มีพื้นที่ ๆ สามารถปลูกต้นไม้ยืนต้นเพิ่มเติมได้จำนวนมาก

                มูลนิธิฯ ได้เริ่มดำเนินโครงการวัดประชาร่วมใจตั้งแต่ปี พ.ศ.๒๕๓๔ ด้วยการจัดทอดผ้าป่า ต้นไม้ยืนต้นแก่วัดต่าง ๆ ทั่วประเทศเป็นปฐมฤกษ์ที่ท้องสนามหลวง โดยสมเด็จพระญาณสังวร สมเด็จพระสังฆราช สกลมหาสังคปรินายก เสด็จเป็นองค์ประธานในพิธี เมื่อวันที่ ๑๘ ตุลาคม ๒๕๓๔ และได้ประทานต้นไม้กว่า ๑,๐๐๐ ต้น แก่เจ้าคณะจังหวัดทั้งสองนิกายทั่วประเทศ รวมทั้งองค์กรที่เป็นแกนนำ พร้อมทั้งอนุมัติให้จัดสร้างพระพุทธรูป ประจำโครงการ โดยประทานพระนามว่า “พระพุทธราชพฤกษวนพิทักษ์อัครศาสดา” หมายถึง พระพุทธศาสดาผู้ทรงเป็นเลิศในการพิทักษ์ไม้และป่า เพื่อเป็นสิริมงคลและความเจริญมั่นคงของโครงการต่อไป

                ในปี ๒๕๓๕ – ๒๕๓๗ มูลนิธิฯ ได้จัดทอดผ้าป่าต้นไม้ตามโครงการอีก ๒๔๗ วัด และในปี ๒๕๓๘ – ๒๕๓๙ ซึ่งเป็นปีกาญจนาภิเษก พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวทรงครองสิริราชสมบัติครบ ๕๐ ปี มูลนิธิฯ ได้จัดโครงการทอดผ้าป่า “โพธิ์พุทธคยากาญจนาภิเษก” เพื่อน้อมเกล้าฯ ถวายเป็นราชสักการะแด่พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัว ประกอบด้วยต้นโพธิ์พุทธคยา ๑ ต้น แผ่นหินอ่อนตรากาญจนาภิเษก และต้นไม้สำคัญในพุทธศาสนา ๕๐ ต้น มอบให้กับวัดทั่วประเทศกว่า ๑,๐๐๐ วัด ซึ่งถือว่าเป็นการปลูกต้นไม้พุทธคยาครั้งยิ่งใหญ่ที่สุดในประเทศไทย

                ต่อมาปี ๒๕๔๐ เนื่องในโอกาสที่สมเด็จพระญาณสังวร สมเด็จพระสังฆราช สกลมหาสังฆ ปรินายก พระชนมายุ ๘๔ พรรษา มูลนิธิฯ ได้มอบกล้าไม้ที่เป็นโอสถของสงฆ์ เช่น มะขามป้อม สมอไทย ฯลฯ จำนวน ๑๐,๐๐๐ ต้น ให้แก่วัดต่าง ๆ ทั้งในกรุงเทพมหานครและจังหวัดต่าง ๆ รวมทั้งสิ้น ๓๓ วัด

                นับตั้งแต่ปี ๒๕๓๔ – ๒๕๔๐ แห่งการดำเนินงานตามโครงการวัดและประชาร่วมใจฯ มูลนิธิฯ ได้มีส่วนร่วมสร้างความร่มรื่นให้แก่วัดในบวรพุทธศาสนากว่า ๒,๐๐๐ แห่งทั่วประเทศ